主要区别在尾绪和体色。南方大口鲶的尾鳍上叶明显长于下叶；土始上下叶等长；胡子鲶尾鳍则为圆形，没分叶，是与背绪相连。大口鲶的体侧和背部呈灰黑色，且色泽较均匀。背部无斑纹，体侧偶有少量色斑，但深浅色斑反差不明显；土鲶的体色为灰黑色，有时带深墨绿色。背部和体侧有深浅交错的花纹。大口鲶与土鲶的腹部都为灰白色，但大口鲶的头腹面有明显的黑色斑点，而土鲶则无此特征。另外，大口鲶与土鲶在苗种期都为6根须。但大口鲶的第二下领须消失的时间晚，在体长10—15厘米时依然存在；而土鲍的第二下领须在5—7厘米时就消失，由此可见鉴别10厘米以上的大口鲶鱼种。南方大口鲶有3对须，胡子鲶则终生4对须。
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