一、沉淀池蓄水处理
由于利氏才女虫和柄海鞘都是由户外沉淀池进入室内育苗池的，且其在无水的环境中不能生存，也不能产生所谓的“休眠卵”，因此清塘对其杀灭极其重要。
1.排水暴晒 育苗结束后，应立即排掉池中剩水，长时间曝晒后，彻底去掉发黑的底泥以及池塘中可供成虫附着的附着基，如硬塑管、竹竿、大型水草等物，并进行池底翻耕。
2.进水 进水时间掌握在12月份至翌年3月份之间，即在当地天然海区中的利氏才女虫幼虫和柄海鞘尚未出现之前注水，并且在注水过程中要严格过滤。进水前池底遍洒生石灰100公斤／亩，随即进水。
3.药物处理 育苗用水前一个月，用20克/立方米有效氯处理沉淀池水，待残氯消失后再施复合肥或生物制剂进行肥水，使水呈黄绿色或黄褐色，维持鲜活嫩爽，透明度在40厘米左右。
二、室内育苗用水处理
一般砂滤或用纱滤袋过滤，可有效阻止虫害的侵入，250目以下网滤效果不大。消毒药物一般使用土霉素2克／立方米、EDTA二钠6～10克／立方米。用水在孵化或移入幼体前1～3天准备好。
三、控制幼体密度 合理投饵，及时倒池，布幼密度以3万～8万只／立方米为宜。应以单胞藻-轮虫-卤虫无节幼体-卤虫成体等活饵食物链为主，少投微颗粒饲料等代用饵料，尽量减少残饵量，不给才女虫或柄海鞘着生提供能量补给。鉴于才女虫和柄海鞘主要在成虫期、三疣梭子蟹幼体发育到大眼幼体期以后才产生危害，因此在大眼幼体变态后的第一天晚上进行倒池十分必要。
四、药物控制
1.才女虫 可用茶籽饼控制利氏才女虫的危害，因为茶籽饼对多毛类毒性较强，而对甲壳类毒性较弱。利氏才女虫浮游幼虫期用10毫克／升的茶籽饼，成虫为20毫克／升。具体使用时可以将饼块粉碎后直接均匀撒入蟹苗池水中，不必事先浸泡茶籽饼。这是因为直接向虫体集中分布的池底撒投，随着茶籽饼中有效成分不断溶解出来，在虫体的周围形成一个高浓度区，其中高浓度的有效成分可以直接作用于虫体，而浸泡过程中，茶籽饼的有效成分可能发生变化而降低毒性。施药的最佳时间应在蚤状幼体Ⅳ期第二天上午。
2.粘线虫 早发现早治疗是减轻病害损失的唯一手段。当肉眼观察到育苗池中出现粘线虫，应立即镜检加以确认。确诊后，治疗方法如下：（1）用福尔马林10～15毫升/立方米。（2）聚维酮碘0.6～0.8 克/立方米。这两种方法对幼体后续发育有不同程度的不良影响。抗生素类药物对该病无明显治疗效果。
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