在目前人工繁殖鳗苗尚未成功的情况下，养殖鳗鱼的苗种主要依靠天然鳗苗资源。
选择捕捞鳗苗的地点，一般以气候温暖受太平洋暖流影响的地区，沿海有江河水闸泄水的地方较为合适。淡水水流畅通之处鳗苗十分集中，如有涡流、回流及流水太急、太深处，鳗鱼不多且在捕捞时不易操作。由于鳗苗溯河时喜欢浮游于水表面，所以水表层的鳗苗比深层多，在闸口前是沿着水边浅水处进行上溯的，所以一般在岸边浅水区进行捕捞。
捕捞鳗苗的渔具、渔法大致有以下几种：
1．定置张网：大规模的捕捞鳗苗即用定置张网。大多是在夜间涨潮时，将张网设置在较宽、较深的河流中或海边，使鳗鱼随着水流进入网内。一般都是利用夜间涨潮时间张捕鳗鱼。
定置张网的产量高，但死苗、杂鱼和垃圾较多，若在尾端连接1个能随水流上下浮动的集苗箱，及时捞取鳗苗，成活率就会提高。
2．三角形手抄网作业：常用的三角手抄网均较轻便，结构简单，一般用各长1.5米的小竹竿2根，交叉并穿上聚乙烯网布，即成三角畚箕状。
手抄网作业常在小河沿岸或浅滩处水深1米范围内单人操作，用手电筒照明，在水中来回捞取。由于手抄网捞取的鳗苗质量较好，成活率高，故使用普遍。
3．板罾网作业：网用聚乙烯或尼龙线编织而成，四方形（一般长宽均为3米），中心为网袋，网目从边缘到中心逐渐加密，中心区网目越小越好。使用时利用小竹竿的弹性，将网四角撑开，然后放入水闸近处水中，人在岸上操作，且备有一长柄小布捞网，当网将要起离水面时，用小捞网捞出网袋中的鳗苗，放入随身所带的装苗容器中。此网单人操作，使用简便灵活，产量虽然较低，但鳗苗质量好，成活率高，在板罾杆下挂电筒、煤油灯或电石灯等以光诱鳗苗，提高产量。
4．曳网类作业：与定置张网的网形相似，但在袖网口装上能曳引的绳索，在离岸更远之处进行捕捞。这种网可系上钢丝绳，配上1千瓦的电动机在水闸前左右来回牵引，以捕取鳗苗。
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